实现逻辑回归
对于这个秘籍,我们将实现逻辑回归来预测样本人群中低出生体重的概率。
做好准备
逻辑回归是将线性回归转换为二元分类的一种方法。这是通过将线性输出转换为 Sigmoid 函数来实现的,该函数将输出在 0 和 1 之间进行缩放。目标是零或一,表示数据点是在一个类还是另一个类中。由于我们预测 0 和 1 之间的数字,如果预测高于指定的截止值,则预测被分类为类值 1,否则分类为 0。出于此示例的目的,我们将指定 cutoff 为 0.5,这将使分类像舍入输出一样简单。
我们将用于此示例的数据将是从作者的 GitHub 仓库获得的低出生体重数据( https://github.com/nfmcclure/tensorflow_cookbook/raw/master/01_Introduction/07_Working_with_Data_Sources/birthweight_data/birthweight.dat )。我们将从其他几个因素预测低出生体重。
操作步骤
我们按如下方式处理秘籍:
- 我们首先加载库,包括
request
库,因为我们将通过超链接访问低出生体重数据。我们还发起了一个会议:
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
import tensorflow as tf
import requests
from sklearn import datasets
from sklearn.preprocessing import normalize
from tensorflow.python.framework import ops
ops.reset_default_graph()
sess = tf.Session()
- 接下来,我们通过请求模块加载数据并指定我们要使用的特征。我们必须具体,因为一个特征是实际出生体重,我们不想用它来预测出生体重是大于还是小于特定量。我们也不想将 ID 列用作预测器:
birth_weight_file = 'birth_weight.csv'
# Download data and create data file if file does not exist in current directory
if not os.path.exists(birth_weight_file):
birthdata_url = 'https://github.com/nfmcclure/tensorflow_cookbook/raw/master/01_Introduction/07_Working_with_Data_Sources/birthweight_data/birthweight.dat'
birth_file = requests.get(birthdata_url)
birth_data = birth_file.text.split('\r\n')
birth_header = birth_data[0].split('\t')
birth_data = [[float(x) for x in y.split('\t') if len(x)>=1] for y in birth_data[1:] if len(y)>=1]
with open(birth_weight_file, 'w', newline='') as f:
writer = csv.writer(f)
writer.writerow(birth_header)
writer.writerows(birth_data)
# Read birth weight data into memory
birth_data = []
with open(birth_weight_file, newline='') as csvfile:
csv_reader = csv.reader(csvfile)
birth_header = next(csv_reader)
for row in csv_reader:
birth_data.append(row)
birth_data = [[float(x) for x in row] for row in birth_data]
# Pull out target variable
y_vals = np.array([x[0] for x in birth_data])
# Pull out predictor variables (not id, not target, and not birthweight)
x_vals = np.array([x[1:8] for x in birth_data])
- 首先,我们将数据集拆分为测试和训练集:
train_indices = np.random.choice(len(x_vals), round(len(x_vals)*0.8), replace=False)
test_indices = np.array(list(set(range(len(x_vals))) - set(train_indices)))
x_vals_train = x_vals[train_indices]
x_vals_test = x_vals[test_indices]
y_vals_train = y_vals[train_indices]
y_vals_test = y_vals[test_indices]
- 当特征在 0 和 1 之间缩放(最小 - 最大缩放)时,逻辑回归收敛效果更好。那么,接下来我们将扩展每个特征:
def normalize_cols(m, col_min=np.array([None]), col_max=np.array([None])):
if not col_min[0]:
col_min = m.min(axis=0)
if not col_max[0]:
col_max = m.max(axis=0)
return (m-col_min) / (col_max - col_min), col_min, col_max
x_vals_train, train_min, train_max = np.nan_to_num(normalize_cols(x_vals_train))
x_vals_test = np.nan_to_num(normalize_cols(x_vals_test, train_min, train_max))
请注意,在缩放数据集之前,我们将数据集拆分为 train 和 test。这是一个重要的区别。我们希望确保测试集完全不影响训练集。如果我们在分裂之前缩放整个集合,那么我们不能保证它们不会相互影响。我们确保从训练组中保存缩放以缩放测试集。
- 接下来,我们声明批量大小,占位符,变量和逻辑模型。我们不将输出包装在 sigmoid 中,因为该操作内置于 loss 函数中。另请注意,每次观察都有七个输入特征,因此
x_data
占位符的大小为[None, 7]
。
batch_size = 25
x_data = tf.placeholder(shape=[None, 7], dtype=tf.float32)
y_target = tf.placeholder(shape=[None, 1], dtype=tf.float32)
A = tf.Variable(tf.random_normal(shape=[7,1]))
b = tf.Variable(tf.random_normal(shape=[1,1]))
model_output = tf.add(tf.matmul(x_data, A), b)
- 现在,我们声明我们的损失函数,它具有 sigmoid 函数,初始化我们的变量,并声明我们的优化函数:
loss = tf.reduce_mean(tf.nn.sigmoid_cross_entropy_with_logits(model_output, y_target))
init = tf.global_variables_initializer()
sess.run(init)
my_opt = tf.train.GradientDescentOptimizer(0.01)
train_step = my_opt.minimize(loss)
- 在记录损失函数的同时,我们还希望在训练和测试集上记录分类准确率。因此,我们将创建一个预测函数,返回任何大小的批量的准确率:
prediction = tf.round(tf.sigmoid(model_output))
predictions_correct = tf.cast(tf.equal(prediction, y_target), tf.float32)
accuracy = tf.reduce_mean(predictions_correct)
- 现在,我们可以开始我们的训练循环并记录损失和准确率:
loss_vec = []
train_acc = []
test_acc = []
for i in range(1500):
rand_index = np.random.choice(len(x_vals_train), size=batch_size)
rand_x = x_vals_train[rand_index]
rand_y = np.transpose([y_vals_train[rand_index]])
sess.run(train_step, feed_dict={x_data: rand_x, y_target: rand_y})
temp_loss = sess.run(loss, feed_dict={x_data: rand_x, y_target: rand_y})
loss_vec.append(temp_loss)
temp_acc_train = sess.run(accuracy, feed_dict={x_data: x_vals_train, y_target: np.transpose([y_vals_train])})
train_acc.append(temp_acc_train)
temp_acc_test = sess.run(accuracy, feed_dict={x_data: x_vals_test, y_target: np.transpose([y_vals_test])})
test_acc.append(temp_acc_test)
- 以下是查看损失和准确率图的代码:
plt.plot(loss_vec, 'k-')
plt.title('Cross' Entropy Loss per Generation')
plt.xlabel('Generation')
plt.ylabel('Cross' Entropy Loss')
plt.show()
plt.plot(train_acc, 'k-', label='Train Set Accuracy')
plt.plot(test_acc, 'r--', label='Test Set Accuracy')
plt.title('Train and Test Accuracy')
plt.xlabel('Generation')
plt.ylabel('Accuracy')
plt.legend(loc='lower right')
plt.show()
工作原理
这是迭代和训练和测试精度的损失。由于数据集仅为 189 次观测,因此随着数据集的随机分裂,训练和测试精度图将发生变化。第一个数字是交叉熵损失:
图 11:在 1,500 次迭代过程中绘制的交叉熵损失
第二个图显示了训练和测试装置的准确率:
Figure 12: Test and train set accuracy plotted over 1,500 generations